為推動原住民教育及相關研究，
於花師教育學院下設置「原住民族教育中心」。


本中心使命如下：

1. 加強原住民基礎教育，推動原住民人才培訓，協助政府推展原住民教育及產業發展政策。

2. 推廣並保存原住民族文化。

3. 配合政府政策，促進原住民族文化深根及生活潛能之發展。

4. 加強國內外民族文化交流，使族群邁向進步，且與現代化接軌，達到永續發展之標的。

5. 執行部落在地實踐與部落遠距伴讀。

6. 每年舉辦全國原住民族教育與原住民特殊教育學術研討會。

7. 跟原住民族地區學校策略聯盟並定期輔導。